sisl.io.tbtrans.phtavncSilePHtrans
==================================















.. currentmodule:: sisl.io.tbtrans

.. autoclass:: phtavncSilePHtrans







   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         


   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
      
         
      
         
      
         

   
      
         
            
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         

   
      
      
         
      
         
      
         











   .. rubric:: Plotting

   .. autosummary::
      :removeprefix: phtavncSilePHtrans.

      phtavncSilePHtrans.plot
      





   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   


   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   
      
      phtavncSilePHtrans.plot.geometry

   
      
      phtavncSilePHtrans.plot.pdos

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   

   








   .. rubric:: Methods

   .. autosummary::
      





   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.ADOS

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.Adensity_matrix

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.BDOS

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.DOS

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.Eindex

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.a2p

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.a_down

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.a_elec

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_ACOHP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_ACOOP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_COHP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_COOP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_current

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.atom_transmission

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.base_directory

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.bloch

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.bond_transmission

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.btd

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.close

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.density_matrix

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.dir_file

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.eta

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.info

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.iter

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.kindex

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.mu

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.n_btd

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_down

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.no_down

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.no_e

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.norm

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.o2p

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_ACOHP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_ACOOP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_COHP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_COOP

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_transmission

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.phonon_temperature

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.pivot

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.pivot_down

   

   

   
   

   
      
         
      
      
      

   

   

   

   
   

   
      
         
      
      
      

   

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.read

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.read_brillouinzone

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.read_data

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.read_geometry

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.read_lattice

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.reflection

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.sparse_atom_to_vector

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.sparse_orbital_to_atom

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.sparse_orbital_to_scalar

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.sparse_orbital_to_vector

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.transmission

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.transmission_bulk

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.transmission_eig

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.vector_transmission

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.write

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.write_tbtav




   .. rubric:: Attributes

   .. autosummary::
      





   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.E

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.a_buf

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.a_dev

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.base_file

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.bond_current

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.cell

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.chemical_potential

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.current

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.current_parameter

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.elecs

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.electron_temperature

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.fano

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.file

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.geometry

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.k

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.kT

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.kpt

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.lasto

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.nE

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_b

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_buffer

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_d

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_dev

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.na_u

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.ne

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.nk

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.nkpt

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.no

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.no_d

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.no_u

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.noise_power

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.o_dev

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.orbital_current

   

   

   
   
      
      

   
      
      
      
      

   

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.shot_noise

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.vector_current

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.wk

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.wkpt

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.xa

   

   

   
   

   
      
      
      
      

   
      
   
      ~phtavncSilePHtrans.xyz